南京信息工程大学工会成立于1964年。近年来，南京信息工程大学工会坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，在上级工会和学校党委领导下，围绕中心、服务大局，大力推进智慧工会建设，构建联系广泛、服务教职工的工会工作体系，充分发挥桥梁纽带作用，团结动员广大教职工落实立德树人根本任务、立足岗位建功立业，助力赋能学校各项事业的高质量发展，打造广大教职工信得过、靠得住、离不开的教职工之家。

学校工会2024年被中华全国总工会授予“全国模范职工之家”称号，2013年被中国教科文卫体工会全国委员会授予“全国教科文卫体系统模范职工之家”称号，2023年大气科学学院被中国教科文卫体工会全国委员会授予“全国教科文卫体系统模范职工小家”称号，2013年文学院被江苏省总工会授予“江苏省模范职工小家”称号，2013年大气科学学院天气学系、2017年自动化学院、2023年大气物理学院被江苏省总工会授予“江苏省工人先锋号”称号。此外，学校2019年被江苏省总工会授予“江苏省五一劳动奖状”，2023年被江苏省厂务公开协调小组评为“全省厂务公开民主管理先进单位”。

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